发表: 2022年4月11日 By

瑞安层

多年来, 研究人员一直在试图快速准确地识别导致癌症等遗传疾病的DNA部分. 博彩平台推荐的研究人员开发了一种新的软件工具,可以改善这一过程,并带来更有针对性的治疗和对癌症患者的了解.

“了解癌症需要识别迫使患者健康细胞不受控制地生长的基因变化,” 助理教授瑞安层. “不幸的是, 任何肿瘤都有数千个这样的变化, 而且大多数是遗传的,而不是突变的,或者根本没有影响. 识别有问题的变异, 博彩平台推荐开发了一种技术,可以快速搜索数千个已知的基因组集,以识别仅在肿瘤中出现的突变.”

这项工作是层实验室正在进行的研究的一部分 计算机科学系BioFrontiers研究所 使用算法来破译非常大的基因组数据集. 这种被称为STIX的新软件专门研究可能导致癌症的大型结构变异. STIX使用二级分析技术从数千个样本中搜索原始数据, 寻找每一种特定肿瘤中存在变异的证据.

《博彩app推荐》杂志的一篇新论文中描述了这一过程 自然方法 它的目的是快速表征一个特定的基因序列是常见的还是罕见的,以及在这些特定的肿瘤细胞中是否可能导致癌症等疾病. 最终目标是根据实际肿瘤中与正常组织相比的序列结果,为患者提供更有针对性的治疗. 最终, 层表示,他们希望以一种任何人都可以使用的方式提供这些信息, 在任何地方.

“隐藏在癌症患者肿瘤基因组中的某个地方是编码肿瘤如何开始不受控制地生长的指令的突变,层说. “不幸的是, 驱动肿瘤的突变与人类发育和功能的所有其他方面的指令混合在一起,使其成为一项复杂而耗时的任务.”

Murad Chowdhury, 他是论文的第一作者,也是层实验室的一名科学家, 他说,计算一个序列在健康人群中的出现次数,以帮助确定它是否是一种疾病驱动突变,这并不是一个新想法. 然而, 该团队的方法扩展了这一理论,包括了大量的基因突变, 它们需要一种根本不同的方法来进行频率估计,因为它们更难检测和表征.

乔杜里说,该团队面临的主要挑战是计算——获取大量数据集并对其进行重组,只需一秒钟就可以在数据中搜索所需的信息. 尽管如此, 事实证明,这种方法是一种有效的工具,未来可能会应用于医学以外的领域.

博彩平台推荐的技术同时减少了数据存储需求,提高了查询速度,因此原本需要数月时间的分析可以更快,乔杜里说. “通过结合机器学习,你基本上可以将这种背景分布用于癌症以外的许多潜在的未来应用.”

层说,研究人员每年都要做很多工作来分析和分类有关肿瘤的信息. 他的实验室使用这类工具的最终目标是使这些投资物有所值且有用.

“该工具旨在改善对数据的博彩平台推荐,以便用户能够快速获得有用和准确的答案,他说. “对博彩平台推荐使用这些数据的方式进行了广泛的改进,使博彩平台推荐能够在其他情况下重复使用这些数据,最终你会从你为获取数据所花的钱中获得更多的价值.”